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基因组算法立功!发现膀胱癌新靶点
膀胱癌是美国第六常见的癌症,根据美国癌症学会(ACS)的统计,2017年美国约有79000人被诊断为膀胱癌,将近17000人死于这种疾病。在过去几年中,逐渐形成了根据基因表达模式对膀胱癌进行分类的趋势。已知一种称为p53样膀胱癌(p53-like bladder cancer)的基因表达模式与侵袭性的肌肉浸润性疾病相关,但人们尚不清楚该亚型对患者预后有何影响。现在,纽约西奈山卫生系统(Mount Sinai Health System in New York)的研究者通过算法模型,确定了两种生物标志物,它们有可能帮助肿瘤学家预测p53样膀胱癌患者的预后,并对其进行针对性治疗。相关论文发表在近期的《Oncogene》上。 据ACS统计,肌肉浸润性膀胱癌的5年生存率最高为63%。患者对常规治疗(如化疗)的反应可能差异很大,因此需要有新的疗法来治疗这种疾病。近年来,使用免疫检查点抑制剂的免疫疗法成为膀胱癌治疗的重大进展,但是一些患者变得耐药。去年,罗氏(Roche)发现一种名为TGF-β的蛋白质与患者对PD-L1抑制剂Tecentriq的反应相关,如果将Tecentriq与抗TGF-β化合物联用,可以提高其有效性。 这次来自西奈山团队的研究确定了两种基于microRNA活性的p53样膀胱癌生物标志物。p53样膀胱癌的命名来自与其相关的活性基因特征。它通常特别具有侵略性,并且对标准化疗耐药,但个体预后可能会有很大差异。microRNA则是一种调节基因表达的遗传物质。研究者利用他们之前开发的计算模型“ActMiR”开展研究,它能根据基因表达的变化确定microRNA的活性。研究者用ActMiR分析了癌症基因组图谱(Cancer Genomic Atlas)中的膀胱癌数据,从中发现了两种microRNA,它们在p53样膀胱癌中有抑癌的作用,其中一种与患者更好的存活率相关。在用ActMiR分析膀胱癌数据之前,西奈山团队已经用多种类型乳腺癌的数据作过验证。 虽然现在还处于早期阶段,西奈山的研究者相信这个研究结果暗示了靶向microRNA有潜力成为膀胱癌新疗法。其他研究者也在探索调控microRNA这个策略,比如伦敦帝国理工学院(Imperial College London)的研究者就在研究可以控制乳腺癌和肺癌的细胞迁移和生长的microRNA。 西奈山的研究者表示还需要做更多的研究,来确定这次发现的两种生物标志物对于p53样膀胱癌患者个体化治疗的意义。“我们的算法不仅让我们深入了解了这种难以捉摸的膀胱癌的潜在细胞机制,而且还揭示了microRNA作为治疗靶点的潜力,”西奈山遗传和基因组学教授朱军博士评论说。
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