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[研发注册] qPCR熔解曲线双峰处理

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发表于 2024-10-10 17:11:17 | 显示全部楼层 |阅读模式

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大家有遇到过熔解曲线的双峰问题,低浓度模板的出现双峰,而且有的时候有双峰有的时候检测没有,这个大概率是引物二聚体还是其他原因呢,NTC阴性对照是正常的。


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大师
发表于 2024-10-11 09:09:32 | 显示全部楼层
在qPCR实验中,熔解曲线出现双峰通常表明存在非特异性扩增。这种情况可能由多种因素引起,包括但不限于引物二聚体的形成、非特异性产物的生成等。

首先,低浓度模板出现双峰的情况,可能是由于引物二聚体的形成。引物二聚体会在qPCR过程中与模板DNA竞争结合,导致非特异性扩增,从而在熔解曲线上形成额外的峰。此外,如果实验条件不稳定或反应体系中存在杂质,也可能导致熔解曲线出现双峰。

针对这一问题,建议采取以下措施:

1. 优化引物设计,避免引物自身或相互之间的互补序列,减少二聚体的形成。

2. 确保所有试剂和样品的纯度,避免引入外源DNA污染。

3. 调整退火温度和时间,以提高特异性扩增的效率。

4. 如果问题持续存在,建议重新评估实验设计和操作流程,必要时进行方法验证。

总之,在qPCR实验中,熔解曲线的双峰问题需要综合考虑多种可能的原因,并通过实验优化来解决。

【鼠鼠还在学习中,内容仅供参考(药搭GMP软件提供技术支持)
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药徒
发表于 2024-10-14 17:39:33 | 显示全部楼层
NTC正常,考虑引物无明显二聚体,低浓度有双峰,高浓度没有,是每一次都样子还是少数几次低浓度有双峰,少数几次,可能是来源于气溶胶污染,每一次则整个体系中有污染物,随着模板量的增加,非特异性信号逐渐被掩盖。你自行对照解决
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